「良いお年を」は、大晦日(12月31日)には使わないのが一般的です。これは、日本の古くからの慣習で、年内のことは30日までに済ませ、大晦日は新年を迎える準備が整った日という考え方に由来しています。
「良いお年を」は「良いお年をお迎え下さい」が短くなった言葉で、「12月31日(大晦日)を無事に迎えることができますように」という意味で使われます。そのため、12月31日より前に使うのが正しい使い方と言われています。
大晦日に挨拶をする場合は、「本年も大変お世話になり、ありがとうございました。 来年もよろしくお願い致します」などと言った挨拶を使うのもよいでしょう。